Теплота, выделяемая в ТЭ при электрохимической реакции, должна быть сброшена для предотвращения недопустимого перегрева. В настоящее время наиболее широко используются две схемы термостатирования: с использованием жидкостного контура и радиатора; с применением воздушного охлаждения.

Выбор схемы термостатирования во многом диктует­ся способом вывода воды и поддержания ее баланса в ЭХГ. Схема термостатирования с использованием жид­костного контура позволяет осуществить стабилизацию температуры с высокой точностью при хорошей равно­мерности поля температур в ТЭ. Это качество схемы термостатирования позволяет более рационально постро­ить систему вывода воды. Схема воздушного охлажде­ния более проста и надежна, но во многом лишена преи­муществ первой.